師妹每次提RNA都要整理儀容儀表
實驗臺也是上上下下打掃的非常亮堂
最后再雙手合十,嘴里不知道念叨著什么
這才能開始提取RNA,!
這一通騷操作
秀的小編我要拜她為玄學(xué)師父了
哈哈哈~
當(dāng)然,,如果能得到理想RNA,
那我相信各位小主也要拜她為師了,!
畢竟對很多同學(xué)來說
提取RNA簡直就是噩夢般的存在
我們來嘮一嘮
如何提取高品質(zhì)的RNA
首先,,如何確定RNA質(zhì)量呢?
常用的方法有UV光譜分析,、熒光染料,、Agilent 2100 Bioanalyzer?、瓊脂糖凝膠電泳等,。這里小編重點介紹UV光譜分析和瓊脂糖凝膠電泳法,。UV光譜分析
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A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波長,如DNA,、RNA,、引物等。
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A280nm是蛋白質(zhì),、酚類最高吸收峰的吸收波長,。
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A230nm是碳水化合物最高吸收峰的吸收波長,如多肽,、苯酚等,。
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A260/A280的比值在1.8-2.2,,說明RNA純度較好。
若比值<1.8,,說明提取的RNA中存在蛋白質(zhì)、酚類等污染;
若比值>2.2,,說明提取的RNA已被DNA污染或者RNA已降解,。
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A260/A230的比值在1.8-2.0,說明RNA純度較好,。
若比值小,,說明提取的RNA中可能存在糖類、鹽或有機溶劑,。
瓊脂糖凝膠電泳
對于真核生物來說,,完整的RNA有3個條帶:28S條帶最亮,其次是18S條帶,,5S條帶最淡(有些試劑盒提取RNA的過程會將5S條帶過濾掉),。通過瓊脂糖凝膠電泳檢測28S、18S的條帶亮度比值評估RNA的純度和完整性,。
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若28S和18S條帶清晰,、明亮、銳利,,且28S條帶亮度約為18S的1.5-2.5倍,,則說明RNA質(zhì)量較好。
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若RNA條帶不亮或缺失,,可能與上樣量不足,、RNA在凝膠中發(fā)生擴散或降解等因素有關(guān)。
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若條帶彌散,,可能原因有RNA已降解,、電泳時電壓或電流過大、上樣量過高或過低等,。
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若條帶大小超過28S,,說明可能存在基因組DNA污染,建議使用DNaseⅠ處理,。
接下來,,當(dāng)然是提取高品質(zhì)的RNA!
正確儲存樣品
采集組織及細胞之后,,應(yīng)立即滅活內(nèi)源性RNase,,以防RNA降解。小編與大家分享了3種方法,。
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樣品加入裂解液(如胍鹽)后,,立即徹底勻漿。
注:加入裂解液之前必須確保樣品處于冷凍狀態(tài),。 -
使用液氮快速冷凍樣品后再置于-80℃保存,。必須保證組織塊足夠小,,才能使其浸入液氮的瞬間就能凍結(jié),以確保RNase瞬間失活,。
注:待提取樣品應(yīng)避免反復(fù)凍融,。為了確保RNA的提取質(zhì)量,請盡量使用新鮮樣品,。
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將樣品充分浸泡在RNA穩(wěn)定劑中,。它是一種無毒、水相收集試劑,,可穩(wěn)定并保護完整,、未冷凍的組織和細胞樣品中的RNA。
注:組織樣品切片一定要?。?0.5 cm),,以便在RNase破壞RNA之前穩(wěn)定劑迅速滲透組織。
RNA提取純化前的準(zhǔn)備工作
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所有物體表面(如實驗儀器,、工作臺面)可用去RNase污染的溶液擦拭,。
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建議設(shè)立RNA抽提專區(qū),實驗用的器具亦可專用,。
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使用的玻璃器皿可進行150℃干熱滅菌4小時的處理,。
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塑料器皿可用0.1% DEPC(焦碳酸二乙酯)水溶液在室溫或37℃處理12小時,然后再高溫高壓滅菌以除去殘留的DEPC,,或者在0.5 M NaOH中浸泡10 min,,然后用水徹底清洗再滅菌烘干,即可去除RNase,。
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采用無菌操作規(guī)程,,注意經(jīng)常更換新手套,以避免RNase污染,。
選擇合適的RNA提取純化方法
(1)溶液法
又稱異硫氰酸胍/苯酚法,、TRIzol法。異硫氰酸胍不僅僅是一種強蛋白變性劑,,而且也是很強的RNase抑制劑,。苯酚的主要作用是裂解細胞,使細胞中蛋白質(zhì),、核酸物質(zhì)解聚,,從而釋放核酸。這種方法簡便快捷,,適用于動植物細胞,、組織、酵母細胞,、細菌等多種樣品的總RNA提取,。
(2)離心柱法
離心柱的材料通常是玻璃纖維,、硅衍生物或者離子交換膜,可以在特定適宜的條件下特異,、可逆地結(jié)合RNA,。操作過程更加方便快捷,且提取的RNA純度較高,,可是存在著有物種特異性、價位較高等不足,。
提取過程中需要注意
(1)徹底勻漿樣品
細胞或組織的充分勻漿能夠減少RNA的損失和降解,。大部分培養(yǎng)細胞加入細胞裂解液后,使用吸管或加樣器吹打等較溫和的方式勻漿,。而組織樣本,、酵母以及細菌通常使用更加劇烈的方式,例如細菌就需要用酶消化其細胞壁,,從而保證細胞充分裂解和RNA的提取得率,。
(2)RNA的正確沉淀
一般情況下,可使用異丙醇來沉淀RNA,。也有使用共沉淀劑(如Glycogen,、Linear Acrylamide)來輔助進行RNA沉淀的特殊情況,以滿足一些下游應(yīng)用的需要,。注意沉淀后應(yīng)避免過于干燥,,以防RNA沉淀難以重新溶解。
(3)RNA的重懸
許多RNA提取步驟的最后一步操作就是溶解純化的RNA沉淀,,通常使用DEPC處理水進行重懸溶解即可,,也有使用特殊的重懸溶液的情況。理想的重懸溶液應(yīng)該滿足三點要求:無RNase污染,、較低的pH值(pH 6-7),、含有螯合劑,以保護RNA不被帶入的RNase降解,。為了幫助溶解,,RNA沉淀置于重懸溶液后可在50 ~ 60℃溫度下孵育5 min,并不時輕搖以加速溶解,。
(4)RNA的保存
重懸的RNA若需短期保存,,可置于-20℃?;蛘邔⑵溥m量分裝后置于-65 ~ -80℃長期保存,,避免反復(fù)凍融。值得注意的是RNA的半衰期比較短,、易降解,,建議抽提后盡快進行后續(xù)實驗,。
重點來啦!總RNA提取需要一款優(yōu)秀的試劑
GenStar明星產(chǎn)品推薦:TRIGene總RNA提取試劑(Cat# P118)
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通用性強:適用于動植物細胞,、組織,、酵母細胞、細菌等多種樣品的總RNA提取,。
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一劑多用:同一樣本可提取總RNA,、DNA和蛋白質(zhì)。
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提取率高:每1×106培養(yǎng)細胞可提取約10 μg總RNA,。
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