文章概述
DNA修飾在形式和功能上有所不同,,但一般不會改變沃森-克里克的堿基互補配對原則,。藍細菌噬菌體S-2L基因組DNA中的2,6-二氨基嘌呤(Z)是個例外,,它完全取代了腺嘌呤,,并與胸腺嘧啶配對形成三個氫鍵進而改變了沃森-克里克堿基配對,。Z-基因組DNA也影響了雙鏈DNA的物理,、化學和機械性質(zhì),,然而44年以來,Z基因組的生物合成,、廣泛程度和重要性仍未被探索,。
噬菌體編碼的PurZ是嘌呤生物合成途徑中腺苷酸琥珀酸合成酶(PurA)的同源蛋白。在多種生物體中,PurA和腺苷琥珀酸裂解酶(PurB)催化肌苷5’-單磷酸(IMP)轉(zhuǎn)化為腺苷5’-單磷酸(AMP),。作者利用生物信息學分析驗證了PurZ參與類似反應(yīng)來產(chǎn)生Z核苷酸,。通過酶學方法作者驗證了多個噬菌體PurZ的酶活性,PurZ和PurB通過兩步酶促反應(yīng)生成dZMP,。隨后dZMP經(jīng)過兩步磷酸化形成二氨基-2’-脫氧腺苷5’-三磷酸(dZTP),,最后通過聚合酶并入噬菌體基因組中;同時作者也表征了噬菌體基因組編碼的HD結(jié)構(gòu)域類水解酶 (dATPase)和DUF550結(jié)構(gòu)域蛋白的功能,。dATPase可以特異性地從宿主的核苷酸庫中去除dATP及其前體dADP,,阻止A堿基摻入噬菌體基因組,從而促進Z基因組的合成,。含有DUF550結(jié)構(gòu)域的酶可以提高dZTP水平,,消耗dATP來促進Z摻入。
作者發(fā)現(xiàn)了上百個噬菌體中都含有保守的PurZ基因,,并選擇其中一株噬菌體-鮑曼不動桿菌噬菌體SH-Ab 15497進行了Z-基因組的驗證,。實驗結(jié)果表明,在SH-Ab 15497的基因組中,,Z幾乎完全取代了A與T配對,,含有Z的基因組并不局限于已知的藍細菌噬菌體S-2L,它的存在可能比之前所認為的更廣泛,。
本文報道的Z-基因組生物合成系統(tǒng),,可以促進Z- DNA的生產(chǎn),用于各種新興應(yīng)用,。顯然,,大自然已經(jīng)想出了一種實現(xiàn)增加堿基多樣性這一目標的方法。作者的研究結(jié)果可能會激發(fā)人們對生命起源和天體生物學的跨學科研究的興趣,。
(Z基因組的生物合成途徑)
本文中使用GenStar的優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品:
StarRuler Color Prestained Protein Marker(10-245 kDa)
(GenStar蛋白Marker結(jié)果圖,,引自原文)
StarPrep Gel Extraction Kit(Cat#D205)
產(chǎn)品特點
簡單快速:膜結(jié)合液與膠塊比例優(yōu)化,避免反復(fù)上樣,;
高回收率:回收效率可達 90%,;
操作安全:無需苯酚/氯仿抽提;
人性化設(shè)計:高品質(zhì)耗材的人性化設(shè)計,,方便使用,。
StarRuler Color Prestained Protein Marker (10-245kDa)(Cat#M222)
產(chǎn)品特點
寬廣分子量范圍;
精準的指示位置,;
清晰的條帶示蹤,;
人性化的色彩設(shè)計。
驚喜福利
科研小伙伴們的福利時刻——免費試用裝,!如果您正好有膠回收或者蛋白Marker的使用需求,,點擊申請免費試用裝 ,!
陪伴用戶,助力科研,,GenStar十數(shù)年如一日,,初心不改。為客戶創(chuàng)造價值,,為科技創(chuàng)新提供保障,,是我們?yōu)橹畩^斗的不竭動力。GenStar愿以高質(zhì)量的產(chǎn)品,,優(yōu)質(zhì)的服務(wù)為用戶的成功奠基,,為科技進步盡一份綿薄之力!